Afyon Kocatepe Üniversitesi Kalite Yönergesinin 7/1/c. maddesine göre kalite komisyonu, ilgili mevzuata aykırı olmamak şartıyla ihtiyaç duyulması halinde kararlaştıracağı konularda araştırma ve değerlendirme yaptırmak ve rapor hazırlatmak amacıyla konuya özgü geçici “Çalışma Grupları” kurabilir. Bu çalışma grupları komisyonun teklifi üzerine Rektör tarafından komisyon üyelerinden birisi başkanlığında konunun uzmanı kişilerden oluşur. Çalışma grubu tarafından hazırlanan raporlara dayanarak komisyon, kurumsal olarak rapor ve benzeri belgeler hazırlar veya ilgili konu hakkında karar verir. Bu maddeden hareketle Kurum İç Değerlendirme Raporunun hazırlık aşamasında her bir ana başlık için oluşturulan çalışma grupları aşağıdaki tabloda yer almaktadır.
| ÇALIŞMA GRUPLARI | ÜYELER | GÖREVLERİ (SEÇİLME NEDENLERİ |
| LİDERLİK, YÖNETİŞİM VE KALİTE | Prof. Dr. Şuayıp ÖZDEMİR | Rektör Yardımcısı |
| Prof. Dr. İsa SAĞBAŞ | Mali İşler ve Kaliteden Sorumlu Rektör Danışmanı | |
| Prof. Dr. Ahmet ALTUNCU | Teknoloji Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Prof. Dr. Mebrure DOĞAN | İlahiyat Fakültesi Dekan Yardımcısı | |
| Prof. Dr. Gökhan Demirtaş | İİBF Dekanı | |
| Doç. Dr Ali AVAN | Kalite Koordinatörü | |
| Öğr. Gör. Dr. Şerife Özgün ÇITAK | Bilim İletişimi Koordinatörü | |
| Hasan DÜZGÜN | Genel Sekreter | |
| Ahmet ERKAN | Strateji Geliştirme Daire Başkanı | |
| Naciye Gülay UTKUGÜN | Personel Daire Başkanı | |
| Ramazan Sami ÇINAR | Bilgi İşlem Daire Başkanı | |
| Mehmet ÇİÇEKLİTAŞ | Stratejik Plan Şube Müdür V. | |
| Nihat ELMAS | İç Kontrol Şube Müdürü | |
| ULUSLARARASILAŞMA | Prof. Dr. Şuayıp ÖZDEMİR | Rektör Yardımcısı |
| Prof. Dr. Mustafa FİŞNE | Uluslararasılaşma Koordinatörü | |
| Doç. Dr. Volkan YÜNCÜ | Uluslararası İlişkiler UAM Müdürü | |
| Doç. Dr. Fatih GÜNGÖR | Eğitim Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Doç. Dr. Cahit ERDEM | Yabancı Diller Yüksekokulu Müdürü | |
| Dr. Öğr. Üyesi Engin AYTEKİN | Turizm Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Dr. Öğr. Üyesi Oğuzhan KALKAN | Yabancı Dil Destek Birimi Koordinatörü | |
| Dr. Öğr. Üyesi Alper GÜNAYDIN | TÖMER Müdürü | |
| Dr. Öğr. Üyesi Şenol GÜNDÖĞDU | İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Dr. Öğr. Üyesi Burak OLUR | Uluslararası Öğrenciler Birim Koordinatörü | |
| EĞİTİM-ÖĞRETİM | Prof. Dr. Murat PEKER | Rektör Yardımcısı |
| Prof. Dr. Şerife Ebru OKUYUCU | Güzel Sanatlar Fakültesi Dekanı | |
| Prof. Dr. Koray KASAPOĞLU | Bologna Koordinatörü | |
| Doç. Dr. Erhan ÜNAL | Bilişim Teknolojileri Meslek Yüksekokulu Müdürü | |
| Doç. Dr. Osman USLU | Sosyal Bilimler Enstitüsü Müdür Yardımcısı | |
| Doç. Dr. Fatih ÖZDİNÇ | İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Doç. Dr. Mahmut Sami KOYUNCU | Eğitim Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Dr. Öğr. Üyesi Ramazan YURTSEVEN | Eğitim Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Dr. Öğr. Üyesi Sadık KAĞA | Mühendislik Fakültesi Dekan Yardımcısı | |
| Yılmaz SARPKAYA | Öğrenci İşleri Daire Başkanı | |
| Emine HARMANCI | Öğrenci Temsilcisi | |
| ARAŞTIRMA ve GELİŞTİRME | Prof. Dr. Şuayıp ÖZDEMİR | Rektör Yardımcısı |
| Prof. Dr. Ahmet YILDIZ | Uygulama ve Araştırma Merkezleri Komisyonu Başkanı | |
| Prof. Dr. Erdinç DÜNDAR | Araştırma ve Geliştirme Koordinatörü | |
| Prof. Dr. Kubilay ASLANTAŞ | Teknoloji Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Prof. Dr. Tuğrul KANDEMİR | Zafer Teknopark Genel Müdürü | |
| Prof. Dr. Atilla EVCİN | TTO Koordinatörü | |
| Prof. Dr. Recep KARA | Veteriner Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Prof. Dr. Bülent AYDOĞDU | Eğitim Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Doç. Dr. Fatih AYHAN | Fen Edebiyat Fakültesi Öğretim Üyesi | |
| Doç. Dr. Mustafa YALÇIN | BAP Koordinatörü | |
| Doç. Dr. Ahmet Raif BOĞA | Kalite Koordinatör Yardımcısı | |
| Dr. Öğr. Üyesi Ahmet KAYSAL | Teknoloji Yarışmaları Koordinatörü | |
| Dr. Öğr. Üyesi Fatih BIYIKLI | Araştırma ve Geliştirme Koordinatör Yardımcısı | |
| Dr. Öğr. Üyesi Recep KURTULUŞ | Araştırma ve Geliştirme Koordinatör Yardımcısı | |
| TOPLUMSAL KATKI | Prof. Dr. Murat Peker | Rektör Yardımcısı |
| Prof. Dr. Elbeyi PELİT | Turizm Fakültesi Dekanı | |
| Prof. Dr. Musa Korkmaz | Veteriner UAM Baş Hekimi | |
| Prof. Dr. Mehmet Yıldız | Spor Bilimleri Fakültesi Dekan Yardımcısı | |
| Doç. Dr. Ender Baykut | AKÜSEM Müdürü | |
| Dr. Öğr. Üyesi Sena Coşkun | Güzel Sanatlar Fakültesi Dekan Yardımcısı | |
| Dr. Öğr. Üyesi Merve Malak | Kalite Koordinatör Yardımcısı | |
| Öğr. Gör. Sümeyye Karcı | Çay MYO Öğretim Elemanı | |
| Gürbüz Bıdık | SKS Daire Başkanı |


